D'Bridder féieren déi verbueden alchemesch Technik vu mënschlecher Transmutatioun an engem Effort fir se erëm opliewen ze loossen wann Trisha vun der Pescht stierft. Als Resultat ass d'Transmutatioun zréck an am Gesetz mat gläichem Austausch, de lénksen Been an dem Alphonse säi ganze Kierper vum Edward ruinéiert. Den Edward verléiert säi richtegen Aarm fir dem Alphonse seng Séil ze retten, et bindend mat enger Bluttversiegelung an eng Rüstung. De Roy Mustang invitéiert den Edward fir eng Method ze ginn fir dem Alphonse säi Kierper erëm ze restauréiere fir vun engem Staat Alchemist ze recherchéieren. Den Edward triumft, gëtt den Numm no senge prosthetesche Post Glidder, de Fullmetal Alchemist.
Dräi Joer duerno sichen d'Elrics nom legendäre Stee vum Philosoph fir hir Ziler ze realiséieren. De Marcoh schéckt seng Notize fir se ze fannen, awer si léieren de wesentleche Faktor fir de Steen wierklech mënschlech Affer ze maachen. De Buddy vu Mustang, Maes Hughes, féiert hir Fuerschung weider, awer gëtt mat engem verkleeden Näid erschoss fir d'Strategie vun den Homunculi ze fannen.
Gesinn mam Izumi, d'Elrics léiere mënschlech Transmutatioun gouf vun hatt op hirem nachgebuerene Kand gemaach. De Gauner Homunculus Gier erfaasst den Alphonse, awer gëtt vum Amestris President King Bradley gerett, gewisen als Homunculus Wrath ze funktionéieren. Gier gëtt doduerch geschmolt a bannen am Original Papp vum Homunculi absorbéiert. De Winry an d'Elrics kommen zréck an d'Zentralstad fir mam Hughes ze goen awer vu sengem Passage ze léieren. De Leitnant Maria Ross ass fir den Hughes 'Mord agerummt, awer anscheinend vum Mustang ëmbruecht. Awer den Edward léiert dem Ross säin Depart war inszenéiert sou datt si vum Mustang aus den USA op Xing geschmuggelt ka ginn, gehollef vum Xingese Prënz Ling Yao. Den Hohenheim gëtt mam Edward zesummegefaasst awer veruecht hien wéinst senger laanger Absence an der Residenz.
Wéi d'Narrativ weidergeet, ginn d'Homunculi vun de Protagonisten ëmmer erëm begéint. Mustang bréngt Loscht; Mustang a Ling erfaasst Gluttony, awer hien endt Näid a säin Null, an den Edward, Ling-ähnleche Bauch. Gluttony hëlt den Alphonse mam Papp ze begéinen, awer de Ling gëtt riets an en Homunculus, speziell deen neisten Avatar vu Gier, wann déi aner aus dem Bauch vu Gluttony flüchten. D'Elrics gi verëffentlecht fir hir Verfollegung weiderzeginn, virausgesat datt de Papp net vun hinne géintiwwer ass.
De General Olivier Armstrong fënnt de Papp an d'Elrics huet en nationalen Transmutatiounsgrupp gegrënnt an huet wëlles senge Bierger ze ginn sou datt hie fäeg ass zu Gëttin ze fannen. Gier erhëlt verréid de Papp a seng fréier Erënnerungen, sech zesumme mat no, an dem Edward, de Chimera-Minions vum Kimblee Hohenheim. Den Hohenheim deelt senge Jongen individuell mat sech datt hien net stierflech ass, huet direkt zu engem liewege Philosoph's Stone vum Papp véierhonnert Joer zréckgewand.
De Verspriechen Dag kënnt a Papp bereet seng Strategie unzefänken mat enger Sonnendäischtert an déi, déi mënschlech Transmutatioun als seng Affer versicht hunn, déi essentiell sinn. Déi verschidde Protagoniste stéiere Konflikter mat de Pappe Minions, mat all den Homunculi oflafen. No engem forcéierte Mustang, souwéi den Elrics, Izumi, Hohenheim gi gesammelt wéi d'Ursaachen de Papp déi national Transmutatioun aktivéiert. Trotzdem aktivéieren Scar an Hohenheim d'Amestrians fir duerch Géigemoossnamen gerett ze ginn. Geier gëtt vum Papp ruinéiert, och wann de Papp iwwer dem Buedem konfrontéiert ass, wou d'Protagonisten him kämpfen fir säi Philosoph's Stone ofzedroen.
Den Alphonse, deem seng Rüstung all duerch de leschte Konflikt géint de Papp ruinéiert ass, gëtt säi Geescht fir de richtegen Aarm erëm z'erreechen, deen de Papp säi Steen ruinéiert, an hien zréck an d'etheresch Paart vun der Wourecht vum Edward schéckt. Den Edward verléiert seng Kraaft fir Alchimie ze maachen fir Séil an dem Alphonse säi Kierper erëmzefannen. Hohenheim gesäit d'Graf wou hie stierft mat engem Grinsen vun Trisha.
